Nel caso di emissione di fatture elettroniche verso la P.A. è obbligatoria l'adozione di numerazioni distinte per le fatture emesse nei confronti della pubblica amministrazione, anche se conservate su carta per la gestione della contabilità.
L'originale della fattura è, infatti, quella elettronica che è conservata digitalmente dal soggetto che provvede alla sua trasmissione alla Pa tramite il sistema di interscambio, gestito da Sogei.
Nel caso di contestuale presenza di fatture elettroniche e cartacee è obbligatoria l'adozione di numerazioni distinte, secondo il parere espresso dall'agenzia delle Entrate nella circolare 36/E/2006